Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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FOXE3Q13461 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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FOXE3Q13461 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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FOXE3Q13461 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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FOXE3Q13461 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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