Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 FCRLA-206ENST00000367949 1792 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 PCSK2-202ENST00000377899 4674 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 TAF5L-204ENST00000366676 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 SRRT-215ENST00000614484 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 CCAR2-206ENST00000520861 3560 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 KCNMA1-265ENST00000639591 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 GADL1-201ENST00000282538 3759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 CELF3-202ENST00000290585 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 TSPEAR-201ENST00000323084 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 PKP4P1-201ENST00000426801 2158 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 PRKAG3-203ENST00000439262 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 NFATC4-209ENST00000553879 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 PPARD-205ENST00000448077 3516 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 ANKZF1-203ENST00000410034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 PAX8-205ENST00000429538 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 ARHGEF10-203ENST00000398560 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 ADAMTS10-211ENST00000597188 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 CACNA2D3-AS1-201ENST00000471265 2078 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 LINC00662-206ENST00000590523 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 FAM230B-208ENST00000451257 3566 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 E2F3-203ENST00000613242 4094 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms