Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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ITGB3BPQ13352 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
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