Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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