Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RLFQ13129 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RLFQ13129 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RLFQ13129 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RLFQ13129 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RLFQ13129 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RLFQ13129 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RLFQ13129 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RLFQ13129 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RLFQ13129 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RLFQ13129 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RLFQ13129 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RLFQ13129 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RLFQ13129 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RLFQ13129 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RLFQ13129 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RLFQ13129 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RLFQ13129 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RLFQ13129 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RLFQ13129 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RLFQ13129 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RLFQ13129 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RLFQ13129 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RLFQ13129 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RLFQ13129 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RLFQ13129 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RLFQ13129 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RLFQ13129 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RLFQ13129 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RLFQ13129 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RLFQ13129 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RLFQ13129 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RLFQ13129 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RLFQ13129 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RLFQ13129 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RLFQ13129 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RLFQ13129 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RLFQ13129 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RLFQ13129 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RLFQ13129 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RLFQ13129 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RLFQ13129 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RLFQ13129 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RLFQ13129 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RLFQ13129 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RLFQ13129 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RLFQ13129 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RLFQ13129 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RLFQ13129 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RLFQ13129 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RLFQ13129 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RLFQ13129 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RLFQ13129 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RLFQ13129 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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