Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FOXD4Q12950 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FOXD4Q12950 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FOXD4Q12950 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXD4Q12950 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
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FOXD4Q12950 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FOXD4Q12950 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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