Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms