Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms