Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNA1Q09470 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms