Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms