Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms