Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CREMQ03060 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CREMQ03060 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CREMQ03060 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREMQ03060 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREMQ03060 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms