Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 TPRKB-201ENST00000272424 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC093835.1-201ENST00000508072 568 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC011773.4-202ENST00000566000 1264 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC105227.1-201ENST00000586227 438 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 TPTE2P2-201ENST00000403471 1466 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC004112.1-201ENST00000431064 561 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC012558.1-201ENST00000451946 622 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 RDH10-203ENST00000519380 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC021006.2-201ENST00000526978 859 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 PIBF1-207ENST00000615625 1098 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.5 ms