Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms