Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX1P78337 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX1P78337 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX1P78337 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX1P78337 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX1P78337 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX1P78337 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX1P78337 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX1P78337 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX1P78337 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX1P78337 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX1P78337 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX1P78337 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX1P78337 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX1P78337 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms