Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ACTA1P68133 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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