Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UFM1P61960 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms