Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ERVFC1-1P60608 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ERVFC1-1P60608 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ERVFC1-1P60608 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ERVFC1-1P60608 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ERVFC1-1P60608 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ERVFC1-1P60608 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ERVFC1-1P60608 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ERVFC1-1P60608 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ERVFC1-1P60608 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ERVFC1-1P60608 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ERVFC1-1P60608 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ERVFC1-1P60608 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ERVFC1-1P60608 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ERVFC1-1P60608 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ERVFC1-1P60608 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ERVFC1-1P60608 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ERVFC1-1P60608 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ERVFC1-1P60608 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ERVFC1-1P60608 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ERVFC1-1P60608 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms