Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPAP53621 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPAP53621 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms