Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF143P52747 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms