Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTPAP49638 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTPAP49638 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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TTPAP49638 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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TTPAP49638 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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TTPAP49638 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTPAP49638 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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