Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PIP4K2AP48426 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms