Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms