Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TSPOP30536 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TSPOP30536 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TSPOP30536 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TSPOP30536 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TSPOP30536 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TSPOP30536 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TSPOP30536 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TSPOP30536 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TSPOP30536 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TSPOP30536 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TSPOP30536 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TSPOP30536 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TSPOP30536 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TSPOP30536 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TSPOP30536 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TSPOP30536 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TSPOP30536 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TSPOP30536 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TSPOP30536 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TSPOP30536 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms