Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms