Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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