Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCND1P24385 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCND1P24385 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCND1P24385 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCND1P24385 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCND1P24385 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCND1P24385 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCND1P24385 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCND1P24385 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCND1P24385 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCND1P24385 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCND1P24385 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCND1P24385 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCND1P24385 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCND1P24385 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCND1P24385 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCND1P24385 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCND1P24385 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCND1P24385 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCND1P24385 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCND1P24385 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCND1P24385 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCND1P24385 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCND1P24385 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCND1P24385 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCND1P24385 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCND1P24385 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCND1P24385 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCND1P24385 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCND1P24385 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCND1P24385 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCND1P24385 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCND1P24385 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCND1P24385 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCND1P24385 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCND1P24385 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCND1P24385 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCND1P24385 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCND1P24385 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCND1P24385 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCND1P24385 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms