Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms