Protein–RNA interactions for Protein: P22460

KCNA5, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA5P22460 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNA5P22460 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms