Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRHP20396 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRHP20396 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRHP20396 TAC3-209ENST00000458521 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRHP20396 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRHP20396 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRHP20396 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRHP20396 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRHP20396 TATDN3-208ENST00000526997 794 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRHP20396 TATDN3-213ENST00000531963 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRHP20396 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRHP20396 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRHP20396 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRHP20396 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRHP20396 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRHP20396 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRHP20396 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRHP20396 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRHP20396 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRHP20396 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRHP20396 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRHP20396 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRHP20396 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRHP20396 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRHP20396 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRHP20396 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRHP20396 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRHP20396 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 RNF170-202ENST00000319073 1265 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRHP20396 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRHP20396 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRHP20396 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRHP20396 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRHP20396 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRHP20396 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRHP20396 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRHP20396 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRHP20396 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRHP20396 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRHP20396 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRHP20396 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRHP20396 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRHP20396 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRHP20396 VGLL1-201ENST00000370634 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRHP20396 AL627095.1-201ENST00000414775 321 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRHP20396 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRHP20396 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRHP20396 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRHP20396 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRHP20396 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRHP20396 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRHP20396 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRHP20396 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRHP20396 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRHP20396 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRHP20396 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRHP20396 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRHP20396 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRHP20396 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRHP20396 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRHP20396 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRHP20396 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRHP20396 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRHP20396 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms