Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CCNA2P20248 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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