Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT4P19013 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT4P19013 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT4P19013 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT4P19013 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT4P19013 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT4P19013 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT4P19013 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT4P19013 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT4P19013 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT4P19013 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT4P19013 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT4P19013 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT4P19013 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT4P19013 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT4P19013 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT4P19013 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT4P19013 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT4P19013 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT4P19013 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms