Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms