Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VCLP18206 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VCLP18206 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VCLP18206 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VCLP18206 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VCLP18206 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VCLP18206 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VCLP18206 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VCLP18206 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VCLP18206 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VCLP18206 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VCLP18206 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VCLP18206 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VCLP18206 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms