Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF4P18085 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF4P18085 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF4P18085 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF4P18085 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF4P18085 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF4P18085 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF4P18085 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF4P18085 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF4P18085 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF4P18085 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF4P18085 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF4P18085 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF4P18085 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF4P18085 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF4P18085 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF4P18085 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF4P18085 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF4P18085 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF4P18085 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF4P18085 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF4P18085 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF4P18085 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF4P18085 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF4P18085 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF4P18085 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF4P18085 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF4P18085 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF4P18085 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF4P18085 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF4P18085 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF4P18085 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF4P18085 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF4P18085 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF4P18085 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF4P18085 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARF4P18085 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF4P18085 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF4P18085 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF4P18085 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF4P18085 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF4P18085 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF4P18085 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF4P18085 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF4P18085 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF4P18085 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF4P18085 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF4P18085 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF4P18085 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF4P18085 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF4P18085 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF4P18085 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF4P18085 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF4P18085 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF4P18085 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF4P18085 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF4P18085 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF4P18085 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF4P18085 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF4P18085 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF4P18085 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF4P18085 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF4P18085 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF4P18085 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF4P18085 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF4P18085 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF4P18085 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF4P18085 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF4P18085 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF4P18085 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF4P18085 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF4P18085 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF4P18085 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF4P18085 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF4P18085 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF4P18085 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF4P18085 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF4P18085 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF4P18085 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF4P18085 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF4P18085 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF4P18085 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF4P18085 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF4P18085 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF4P18085 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF4P18085 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF4P18085 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF4P18085 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF4P18085 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF4P18085 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF4P18085 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF4P18085 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF4P18085 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF4P18085 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF4P18085 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF4P18085 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF4P18085 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF4P18085 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF4P18085 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF4P18085 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms