Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPB42P16452 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPB42P16452 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPB42P16452 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPB42P16452 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPB42P16452 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPB42P16452 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPB42P16452 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPB42P16452 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPB42P16452 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
EPB42P16452 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPB42P16452 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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EPB42P16452 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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EPB42P16452 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPB42P16452 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
EPB42P16452 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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EPB42P16452 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPB42P16452 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPB42P16452 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPB42P16452 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPB42P16452 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPB42P16452 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPB42P16452 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPB42P16452 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPB42P16452 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
EPB42P16452 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPB42P16452 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPB42P16452 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPB42P16452 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPB42P16452 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EPB42P16452 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EPB42P16452 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EPB42P16452 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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EPB42P16452 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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EPB42P16452 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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EPB42P16452 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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EPB42P16452 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPB42P16452 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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EPB42P16452 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPB42P16452 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPB42P16452 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPB42P16452 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPB42P16452 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPB42P16452 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPB42P16452 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPB42P16452 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPB42P16452 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPB42P16452 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPB42P16452 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPB42P16452 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPB42P16452 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPB42P16452 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPB42P16452 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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