Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms