Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BMP3P12645 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BMP3P12645 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms