Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL6A2P12110 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms