Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RARBP10826 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RARBP10826 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RARBP10826 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RARBP10826 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RARBP10826 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RARBP10826 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RARBP10826 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RARBP10826 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RARBP10826 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RARBP10826 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms