Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYBBP04839 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms