Protein–RNA interactions for Protein: P02679

FGG, Fibrinogen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGGP02679 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGGP02679 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGGP02679 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGGP02679 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGGP02679 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGGP02679 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGGP02679 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGGP02679 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGGP02679 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGGP02679 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGGP02679 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGGP02679 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGGP02679 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGGP02679 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGGP02679 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGGP02679 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGGP02679 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGGP02679 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGGP02679 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGGP02679 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGGP02679 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGGP02679 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGGP02679 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms