Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MATN4O95460 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MATN4O95460 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MATN4O95460 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MATN4O95460 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MATN4O95460 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MATN4O95460 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MATN4O95460 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MATN4O95460 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MATN4O95460 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MATN4O95460 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MATN4O95460 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MATN4O95460 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MATN4O95460 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MATN4O95460 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MATN4O95460 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MATN4O95460 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MATN4O95460 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MATN4O95460 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MATN4O95460 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MATN4O95460 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MATN4O95460 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MATN4O95460 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MATN4O95460 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MATN4O95460 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MATN4O95460 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MATN4O95460 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MATN4O95460 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MATN4O95460 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MATN4O95460 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MATN4O95460 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MATN4O95460 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MATN4O95460 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MATN4O95460 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MATN4O95460 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MATN4O95460 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms