Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms