Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLIN3O60664 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLIN3O60664 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLIN3O60664 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PLIN3O60664 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLIN3O60664 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLIN3O60664 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLIN3O60664 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLIN3O60664 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLIN3O60664 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLIN3O60664 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLIN3O60664 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLIN3O60664 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLIN3O60664 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLIN3O60664 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLIN3O60664 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLIN3O60664 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLIN3O60664 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLIN3O60664 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLIN3O60664 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLIN3O60664 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLIN3O60664 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLIN3O60664 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLIN3O60664 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLIN3O60664 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLIN3O60664 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLIN3O60664 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLIN3O60664 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLIN3O60664 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLIN3O60664 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLIN3O60664 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLIN3O60664 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PLIN3O60664 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PLIN3O60664 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PLIN3O60664 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PLIN3O60664 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLIN3O60664 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLIN3O60664 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PLIN3O60664 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLIN3O60664 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLIN3O60664 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PLIN3O60664 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLIN3O60664 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PLIN3O60664 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PLIN3O60664 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PLIN3O60664 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PLIN3O60664 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PLIN3O60664 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLIN3O60664 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PLIN3O60664 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PLIN3O60664 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLIN3O60664 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PLIN3O60664 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLIN3O60664 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLIN3O60664 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLIN3O60664 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PLIN3O60664 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLIN3O60664 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PLIN3O60664 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PLIN3O60664 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PLIN3O60664 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLIN3O60664 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PLIN3O60664 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLIN3O60664 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PLIN3O60664 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PLIN3O60664 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLIN3O60664 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PLIN3O60664 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLIN3O60664 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLIN3O60664 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLIN3O60664 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLIN3O60664 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLIN3O60664 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLIN3O60664 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLIN3O60664 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLIN3O60664 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PLIN3O60664 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLIN3O60664 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLIN3O60664 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLIN3O60664 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLIN3O60664 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLIN3O60664 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLIN3O60664 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLIN3O60664 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLIN3O60664 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PLIN3O60664 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PLIN3O60664 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PLIN3O60664 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PLIN3O60664 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PLIN3O60664 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLIN3O60664 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLIN3O60664 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PLIN3O60664 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PLIN3O60664 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLIN3O60664 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PLIN3O60664 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLIN3O60664 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLIN3O60664 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLIN3O60664 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLIN3O60664 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms