Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP104O60308 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP104O60308 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms