Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms