Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLGNO14967 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms