Protein–RNA interactions for Protein: O14910

LIN7A, Protein lin-7 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7AO14910 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN7AO14910 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms