Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3B1O00203 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms